Κατά τη διάρκεια της μάχης της Βρετανίας, της Γερμανίας Luftwaffe ξεκινά μια βαριά αεροπορική επιδρομή το βράδυ στο Λονδίνο. Ο θόλος του καθεδρικού ναού του Αγίου Παύλου διατρυπάται από μια ναζιστική βόμβα, αφήνοντας το υψηλό βωμό σε ερείπιο. Ήταν μια από τις λίγες περιπτώσεις που ο καθεδρικός ναός του 17ου αιώνα υπέστη σημαντικές ζημίες κατά τη διάρκεια σχεδόν αδιάκοπης βομβιστικής επίθεσης της Γερμανίας στο Λονδίνο το φθινόπωρο του 1940.
Σύμφωνα με την παράδοση, ένας ρωμαϊκός ναός στη θεά Νταϊάνα κάποτε βρισκόταν στο λόφο Ludgate στο χώρο του καθεδρικού ναού του Αγίου Παύλου. Το 604 π.Χ., ο βασιλιάς Aethelberht αφιέρωσα τον πρώτο χριστιανικό καθεδρικό ναό εκεί στον Άγιο Παύλο. Αυτός ο καθεδρικός ναός έκαψε και η αντικατάστασή του καταστράφηκε από τους Βίκινγκς το 962. Ένας τρίτος καθεδρικός ναός καταστράφηκε από πυρκαγιά το 1087 και αντικαταστάθηκε από μια μεγάλη κανονική δομή που ολοκληρώθηκε τον 13ο αιώνα. Τον 16ο αιώνα, ο τέταρτος καθεδρικός ναός έπεσε σε καταστροφή και υπέστη ζημιά από πυρκαγιά και περαιτέρω βλάβη έγινε κατά τους αγγλικούς εμφύλιους πολέμους του 17ου αιώνα. Στη δεκαετία του 1660, ο αγγλικός αρχιτέκτονας Sir Christopher Wren στρατολογήθηκε για να επισκευάσει τον καθεδρικό ναό, αλλά παρενέβη η μεγάλη πυρκαγιά του Λονδίνου, καταστρέφοντας τον καθεδρικό ναό του παλαιού Αγίου Παύλου το 1666.
Μετά την πυρκαγιά, ο Wren σχεδίασε έναν νέο καθεδρικό ναό του Αγίου Παύλου, με δεκάδες μικρότερες νέες εκκλησίες να κυμαίνονται γύρω του σαν δορυφόρους. Ο καθεδρικός ναός ήταν αριστούργημα του Wren, με μπαρόκ σχεδιασμό και περίοπτη, εντυπωσιακή τρούλο. Ο ίδιος ο Wren έβαλε το θεμέλιο το 1675 και το 1710 έβαλε την τελική πέτρα στη θέση του. Όταν ο αρχιτέκτονας πέθανε το 1723, θάφτηκε με μεγάλη τελετή στο St. Paul's. Μια επιγραφή κοντά στον τάφο του διαβάζει, Lector, si monumentum requiris, περισπασμόςΓια πολλούς άλλους αξιοσημείωτους βρετανούς πολίτες, αργότερα τον εντάξαμε στις κρύπτες του Αγίου Παύλου, συμπεριλαμβανομένων των στρατιωτικών ήρωων του Λόρδου Νέλσον και του δούκα του Ουέλλινγκτον.
Ο καθεδρικός ναός του Αγίου Παύλου αποτέλεσε έμπνευση για το βρετανικό λαό κατά τη διάρκεια του Β ' Στη μάχη της Βρετανίας, ο Luftwaffe προσπάθησε να βγάλει τη Βρετανία σε υποταγή, χτυπώντας το Λονδίνο και άλλες μεγάλες πόλεις, αλλά ο Άγιος Παύλος διέφυγε θαυματουργώς από μεγάλες βλάβες από βόμβες, ακόμη και όταν τα ιστορικά κτίρια γύρω από το ξενοδοχείο μειώθηκαν σε ερείπια. Οι εικόνες του Αγίου Παύλου πλαισιωμένες από καπνό και φωτιά έγιναν σύμβολο του αδάμαστο πνεύμα της Βρετανίας. Οι μη στρατιωτικές αμυντικές ταξιαρχίες, συμπεριλαμβανομένου του πυροσβεστικού σταθμού του Αγίου Παύλου, προστατεύουν τη δομή από τη φωτιά και σε ένα σημείο αφαιρέθηκε με μεγάλη βαρύτητα από τη στέγη του καθεδρικού ναού μια βόμβα που δεν είχε εκραγεί. Παρά τη ζημιά που προκλήθηκε τη νύχτα της 9ης Οκτωβρίου 1940, ο καθεδρικός ναός επέζησε Αιφνιδιαστική επίθεση σε μεγάλο βαθμό άθικτο. Το 1944, οι καμπάνες του Αγίου Παύλου έσπευαν να γιορτάσουν την απελευθέρωση του Παρισιού και το 1945 οι υπηρεσίες που σημάδεψαν το τέλος του πολέμου στην Ευρώπη παρακολούθησαν 35.000 άτομα.
